هزینه رسیدگی به هر پرونده در دادسرای ویژه روحانیت در بودجه سال ۹۷ حدود ۲۰۰ هزار تومان در نظر گرفته شده است. این میزان سه برابر هزینه سرانه رسیدگی به پرونده‌‌های قضایی شهروندان معمولی در محاکم و دادسراهای عادی کل کشور است.

به نقل از عصر ایران، طبق بودجه سال ٩٧ سهم دادستانی ویژه روحانیت ۳۷ میلیارد و ۳۰۰ میلیون تومان عنوان شده است.

با توجه به جمعیت ١۵٠ الی ٢٠٠ هزار نفری روحانیون و طلاب در ایران، دادگاه ویژه روحانیت به ازای هر یک از آنان حدود ۲۰۰ هزار تومان از بودجه عمومی را دریافت می‌کند.

این در حالی است که بودجه سال ۱۳۹۷ برای محاکم و دادسراهای کل ایران ۵۱۸۰ میلیارد تومان است؛ یعنی ۶۵ هزار تومان به ازای هر شهروند ایرانی و این به معنی تساوی یک آخوند با سه شهروند عادی در ایران است.

دادگاه ویژه روحانیت مستقیم زیر نظر رهبر ایران اداره می‌شود. این دادگاه یکی از مراجع قضایی ایران است که به جرائم روحانیون ایران رسیدگی می‌کند. این دادگاه ویژه به دستور آیت‌الله خمینی تشکیل شد و در اصول قانون اساسی تدوین نشده است.