حسن روحانی در پیگیری وعده‌ هایی که‌ به‌ اقلیتهای ملی و دینی ایران داده‌ بود طی حکمی علی یونسی را به سمت دستیار ویژه‌ خود در آنچه‌ که‌ امور اقوام و اقلیتهای دینی و مذهبی خوانده منصوب کرد. یونسی که‌ پیشتر در دولت محمد خاتمی وزیر اطلاعات بود از چهره‌ های امنیتی نظام محسوب می‌شود .

تعیین وزیر اطلاعات از سالها پیش و از زمان دولت نخست هاشمی رفسنجانی با نظر مستقیم رهبر جمهوری اسلامی بوده‌ و این رویه‌ تاکنون نیز ادامه‌ دارد.  

رئیس جمهور ایران با این انتصاب می‌تواند مدعی باشد که‌ به‌ بخشی از وعده‌ هایش عمل کرده‌ ، اما از سوی دیگر تحقق این امر نشانی از حذف نگاه امنیتی به‌ خلقهای ایران و اقلیتهای دینی و مذهبی دراین کشور را با خود ندارد. انتصاب یک چهره‌ امنیتی هرچند به ظاهر اصلاح طلب, یقینا نمی‌تواند پاسخگوی مطالبات خلقها و اقلیتهای دینی و مذهبی در ایران باشد.

در این باره‌ فعالین سیاسی و ناظران حقوق خلقها بر این باورند که‌ روحانی در حکم مکتوب خود بدرستی نوشته‌ که‌ " نظر به مراتب تعهد، تخصص و تجارب ارزشمند، شما را به عنوان «دستیار ویژه رییس‌جمهور در امور اقوام و اقلیت‌های دینی و مذهبی» برمی‌گزینم.